À l’occasion de la conférence SuperComputing24 (#SC24), à Atlanta, en Géorgie, NVIDIA a annoncé que plus de 200 entreprises biopharmaceutiques et de biotech informatique, établissements universitaires et chercheurs en IA adoptaient le framework open source BioNeMo de l’entreprise. La conférence SC24 réunit des dirigeants des secteurs technologique, de la recherche et scientifique afin de discuter de l’avenir du supercalcul et de son rôle dans la résolution des problèmes les plus urgents au monde. BioNeMo associe des modèles d’IA avancés au calcul accéléré pour traiter d’immenses jeux de données, offrant un nouveau niveau de supercalcul au service de l’innovation pharmaceutique. Kimberly Powell, vice-présidente de NVIDIA chargée de la santé, a souligné le potentiel du framework pour faire progresser les traitements susceptibles de sauver des vies.
« La convergence de l’IA, du calcul accéléré et de jeux de données toujours plus vastes offre des possibilités sans précédent à l’industrie pharmaceutique, comme en témoignent les récents prix Nobel de chimie », a déclaré Powell. « Pour contribuer à percer les complexités des systèmes biologiques, nous avons présenté le BioNeMo Framework, qui permettra aux chercheurs du monde entier d’accélérer le développement de traitements susceptibles de sauver des vies. »
Les leaders du secteur soutiennent cette innovation
Des organisations de premier plan ont déjà adopté BioNeMo, notamment Argonne National Laboratory, Genentech, Weights & Biases et d’autres pionniers des biotechnologies et des sciences computationnelles. Des chercheurs comme Arvind Ramanathan, responsable du groupe de sciences computationnelles à Argonne National Laboratory, ont salué le framework, soulignant sa capacité à faire évoluer l’entraînement de modèles biologiques sans nécessiter de compétences avancées en informatique.
« Argonne a contribué à des modèles biologiques comportant des milliards de paramètres, qui nécessitent des logiciels spécialisés pour être entraînés dans des environnements de calcul haute performance », a déclaré Ramanathan. « Avec BioNeMo, Argonne et l’ensemble de la communauté des biotechnologies disposent d’une solution open source de niveau entreprise qui permet aux chercheurs de faire évoluer facilement l’entraînement de grands modèles biologiques fondamentaux — y compris dans des laboratoires qui ne disposeraient autrement pas de l’expertise informatique nécessaire. »
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La plateforme BioNeMo de nouvelle génération
Cette plateforme propose également des outils tels que les microservices NVIDIA NIM et les BioNeMo Blueprints, qui simplifient le déploiement de l’IA pour la découverte de médicaments. Les microservices NIM peuvent être déployés sur site, dans n’importe quel centre de données ou dans le cloud, afin de fournir rapidement des prédictions sur les structures des protéines et l’orientation des molécules. Les BioNeMo Blueprints proposent des workflows d’IA personnalisables qui simplifient des processus complexes comme le criblage virtuel, en réduisant les délais et les coûts.
La plateforme prend en charge les modèles de pointe suivants :
- AlphaFold2 : Ce modèle d’apprentissage profond développé par Google DeepMind est conçu pour transformer la prédiction de la structure des protéines. Des chercheurs ont constaté que cet outil accélère jusqu’à cinq fois les prédictions de structure protéique.
- DiffDock 2.0 : Ce modèle, qui prédit les orientations moléculaires 6,2 fois plus rapidement et avec une précision supérieure de 16 %, est proposé par la recherche du MIT et entraîné sur le jeu de données de référence PLINDER. Il fournit des prédictions plus rapides et plus précises de l’ancrage moléculaire, essentielles à la conception de médicaments.
- ProteinMPNN et RFdiffusion : Ces modèles accélèrent la conception de nouvelles protéines et le développement de traitements de nouvelle génération.
Plus de 200 entreprises, notamment des start-up et des leaders pharmaceutiques mondiaux, ont déjà adopté BioNeMo pour soutenir leurs activités de découverte de médicaments. Des fournisseurs de cloud et des intégrateurs de systèmes comme AWS, Deloitte et Accenture déploient également des solutions BioNeMo auprès d’entreprises du monde entier, étendant encore sa portée.
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